| 1 |
جایگاه درس در برنامه درسی دوره |
این درس به دانشجو کمک می کند تا به مفاهیم بنیادی و کاربردی بیوانفورماتیک در بیوشیمی آشنایی مناسبی پیدا کند. |
| 2 |
هدف کلی |
آشنایی دانشجویان با مفاهیم بنیادی و کاربردی بیوانفورماتیک در بیوشیمی و آماده سازی آنها برای استفاده از بیوانفورماتیک در پایاننامه و تحقیقات کاربردی. |
| 3 |
اهداف یادگیری |
اهداف یادگیری زیر مدنظر است:
1. آشنایی دانشجویان با مفاهیم بنیادی و کاربردی بیوانفورماتیک در بیوشیمی.
2. توانایی تحلیل دادههای مولکولی و پروتئینی با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی.
3. تسلط بر پایگاههای داده مرتبط با ساختار و عملکرد پروتئینها.
4. توانایی تفسیر نتایج حاصل از توالییابی، مدلسازی ساختاری و طراحی دارو.
5. آمادهسازی دانشجویان برای استفاده از بیوانفورماتیک در پایاننامه و تحقیقات کاربردی. |
| 4 |
روش تدریس |
روش تدریس بدو صورت تئوری و عملی خواهد بود.
در بخش تئوری انتقال مفاهیم و تعاریف از طریق ارائه های پاورپوینت خواهد بود.
در بخش عملی تمرینات عملی با استفاده از سایت کامپیوتری انجام شده و هر دانشجو وظایف محوله را بصورت انفرادی انجام خواهد داد. |
| 5 |
منبع |
منابع انگلیسی:
1. Bioinformatics and Functional Genomics – Jonathan Pevsner (2022)
2. Structural Bioinformatics – Philip Bourne
3. Introduction to Protein Structure – Branden & Tooze
4. Bioinformatics for Biologists – Pavel Pevzner
منابع فارسی:
• مبانی بیوانفورماتیک – انتشارات دانشگاه تهران
• بیوانفورماتیک کاربردی در بیوشیمی – دکتر نادعلی و همکاران
پایگاههای آموزشی رایگان:
• NCBI Tutorials
• EMBL-EBI Academy
• Coursera Bioinformatics Specialization |
| 6 |
مواد و امکانات آموزشی |
مواد درسی و تئوری در سایت آزمایشگاه کامپیوتری بصورت نظری و عملی با استفاده از کامپیوتر فردی انجام خواهد شد |
| 7 |
وظایف دانشجو |
در پایان این درس انتظار میرود دانشجو بتواند وظایف زیر را در حد مناسبی به انجام برساند:
• پایگاههای داده ژن و پروتئین را جستجو و دادهها را استخراج نماید.
• همردیفی توالیها را انجام داده و معناداری بیولوژیکی آن را تحلیل کند.
• ساختار سهبعدی پروتئینها را پیشبینی و اعتبارسنجی نماید.
• مسیرهای متابولیک و شبکههای زیستی را تحلیل و تفسیر کند.
• از ابزارهای بیوانفورماتیک در تفسیر کارکردی پروتئین ها استفاده نماید. |
| 8 |
نحوه ارزشیابی |
ارزیابی در دو بخش تئوری و عملی با تاکید بر فعالیت های کلاسی و انجام تکالیف و پروژه های محوله صورت می گیرد. |
| 9 |
شایستگی های پایه |
دانش نظری و عملی دانشجویان در زمینه بیوانفورماتیک و نحوه استفاده از آن در پروژه و تحقیقات علمی و کاربردی تقویت خواهد شد. |