سرفصل مطالب

سرفصل مطالب
# سرفصل مطالب طرح درس (براساس سرفصل)
1 مقدمه بیوانفورماتیک (تاریخچه، جایگاه در بیوشیمی، داده‌های زیستی)
2 معرفی پایگاه‌های داده توالی (انواع پایگاه‌ها، قالب‌ها (FASTA، GenBank)) (1)
3 ادامه معرفی پایگاه‌های داده توالی (انواع پایگاه‌ها، قالب‌ها (FASTA، GenBank))
4 اصول همترازی توالی‌ها (BLAST، Multiple Alignment، E-value)
5 ادامه اصول همترازی توالی‌ها (BLAST، Multiple Alignment، E-value)
6 اصول طراحی و ارزیابی پرایمرها
7 بیوانفورماتیک پروتئین ها (آنالیز ترکیب اسیدهای آمینه، الگوهای موتیفی)
8 ادامه بیوانفورماتیک پروتئین ها (آنالیز ترکیب اسیدهای آمینه، الگوهای موتیفی)
9 پیش‌بینی ساختار ثانویه و سوم پروتئین ها (روش‌های همولوژی‌مدلسازی، دینامیک مولکولی)
10 ادامه پیش‌بینی ساختار ثانویه و سوم پروتئین ها (روش‌های همولوژی‌مدلسازی، دینامیک مولکولی)
11 ساختار عملکردی پروتئین ها (جایگاه‌های فعال، دامین‌های آنزیمی)
12 بیوانفورماتیک ژنوم و ترنسکریپتوم (RNA-Seq، رگولاسیون ژن)
13 شبکه‌های زیستی و متابولیک (KEGG، Reactome و تحلیل مسیرهای متابولیکی)
14 ادامه شبکه‌های زیستی و متابولیک (KEGG، Reactome و تحلیل مسیرهای متابولیکی)
15 ارائه پروژه های عملی
16 جمع بندی و رفع اشکالات احتمالی دانشجویان