| 1 |
جایگاه درس در برنامه درسی دوره |
درس بیوانفورماتیک و مدلینگ در میکروبیولوژی مواد غذایی به ارزش 2 واحد نظری، یکی از دروس اصلی و الزامی در مقطع دکتری گرایش زیست فناوری مواد غذایی است.در این درس کاربرد کامپیوتر (رایانه) و نرم افزار های کامپیوتری در مسایل بیولوژی مولکولی می باشد. |
| 2 |
هدف کلی |
آشنایی با داده ها و اطلاعات ورودی و نتایج خروجی در بیوانفورماتیک و نحوه کاربرد و آشنایی با نرم افزار های مختلف کامپیوتری در بیولوژی مولکولی، آشنایی با بانک های اطلاعاتی ، اطلاعات ورودی شامل توالی های DNA و RNA و پروتئین ها، تشخیص ساختمان پروتئین، آشنایی با بانک اطلاعاتی NCBI ، جستجوی بانک های اطلاعاتی و بررسی همردیفی توالی ها، اشنایی با فرمت فایل ها] همردیفی چند گانه و تعیین روایط خویشاوندی بین میکروارگانیسم ها، پروتیئن Domain ، تفسیر توالی ها |
| 3 |
شایستگی های پایه |
دانشجویان مقطع دکتری، قبل از انتخاب این درس در مقطع دکتری و یا کارشناسی ارشد، دروسی مرتبط با این درس مانند بیولوژی مولکولی را گذرانده اند و دارای اطلاعات خوبی در زمینه مباحث بیولوژی مولکولی و مباحث پیش زمینه درس بیوانفورماتیک می باشند. |
| 4 |
اهداف یادگیری |
آشنایی با کاربرد کامپیوتر و نرم افزار های مختلف on-line و off-line و تحت وب در بیوانفورماتیک، اطلاعات ورودی: شامل توالی های DNA و RNA و پروتیئن ها، تشخیص ساختمان پروتئین، آشنایی با بانک های اطلاعاتی : فرمت فایل ها، بانک های اطلاعاتی تفسیر شده ، بانک های اطلاعاتی ژنومی موجودات مختلف - سایر بانک های اطلاعاتی |
| 5 |
فایل |
Pdf File |
| 6 |
روش تدریس |
تدریس به صورت ارائه اسلایدهای پاورپوینت و تدریس نرم افزارهای آنلاین و آفلاین بیوانفورماتیک در اتاق کامپیوتر دانشکده
دادن تکالیف به دانشجویان به صورت take home |
| 7 |
وظایف دانشجو |
شرکت منظم در کلاس های درس
انجام تکالیف در منزل و انجام پروژه های احتمالی
ارایه سمینار در کلاس درس |
| 8 |
منبع |
1- Bioinformatics for Dummies, 2nd Edition, By: Jean-Michel Claverie and Cedric Notredame, Published by Wiley Publishing, Inc. 2007.
2- Essential Bioinformatics. By: JIN XIONG. Cambridge university press. 2006.
3- بیوانفورماتیک به زبان ساده . چاپ دوم. تالیف ژان میشل کلاوری. ترجمه حسن کربکندی و همکاران. دانشگاه علوم پزشکی اصفهان. |
| 9 |
مواد و امکانات آموزشی |
کامپیوتر و یا لب تاپ
نرم افزارهای آفلاین یا آنلاین مرتبط با درس بیوانفورماتیک |
| 10 |
نحوه ارزشیابی |
آزمون میان ترم
آزمون پایان ترم
کوییز ها و ازمونک
ارایه سمینار و پروژه
تکالیف کلاسی |